Если у налогоплательщика есть право на льготу и он ею не воспользовался, он вправе реализовать свое право на льготу. Например, подав заявление в налоговый орган и уточненную налоговую декларацию. После выездной налоговой проверки можно подать его в рамках её проведения. В соответствии с Постановлением Пленума ВАС РФ от 30 июля 2013 г. № 57).
В связи с этим, по мнению судей, в случае возникновения спора о том, имел ли место отказ налогоплательщика от использования льготы, следует исходить из того, что факт неучета налогоплательщиком налоговой льготы при составлении декларации за конкретный налоговый период сам по себе не означает его отказ от использования соответствующей налоговой льготы в этом периоде.